Η Διεύθυνση Οικονομικών Υπηρεσιών έχει την ευθύνη για την εύρυθμη, αποτελεσματική και σύννομη διαχείριση των οικονομικών πόρων του Ιδρύματος, την αξιοποίηση των πόρων που διατίθενται για την κατασκευή, τη μετασκευή και τη συντήρηση των κτιριακών υποδομών και των εγκαταστάσεων, σύμφωνα με τον εγκεκριμένο προϋπολογισμό και τις προτεραιότητες και τους στόχους του Ιδρύματος, όπως καθορίζονται από τα Όργανα της Διοίκησής του
Η Διεύθυνση Οικονομικών Υπηρεσιών συγκροτείται από τα ακόλουθα τμήματα:
α) Τμήμα Προϋπολογισμού και Λογιστηρίου
Αντικείμενο του Τμήματος είναι η κατάρτιση, η παρακολούθηση της εκτέλεσης, η αναμόρφωση του Τακτικού Προϋπολογισμού και του Προϋπολογισμού Δημοσίων Επενδύσεων καθώς και η διεκπεραίωση κάθε διαδικασίας που αφορά έσοδα και δαπάνες
β) Τμήμα Μισθοδοσίας
Αντικείμενο του Τμήματος Μισθοδοσίας είναι η διεκπεραίωση κάθε διαδικασίας που αφορά τη μισθοδοσία του πάσης φύσεως προσωπικού (μόνιμου, με σχέση εργασίας ιδιωτικού δικαίου ορισμένου και αορίστου χρόνου), την παρακολούθηση και υλοποίηση των μισθολογικών μεταβολών του πάσης φύσεως προσωπικού σε συνεργασία με τη διοικητική υπηρεσία, καθώς και τη μηχανογραφική επεξεργασία και ανάλυση όλων των σχετικών στοιχείων
γ) Τμήμα Προμηθειών και Περιουσίας
Στην αρμοδιότητα του Τμήματος Προμηθειών και Περιουσίας υπάγονται όλα τα θέματα που έχουν σχέση με την υλοποίηση διαγωνισμών και προμηθειών σύμφωνα με τις ισχύουσες διατάξεις, καθώς και η καταγραφή της περιουσίας του Ιδρύματος
Στην Πάτρα και στην Καλαμάτα λειτουργούν Περιφερειακά Τμήματα, σε επίπεδο διοικητικής μονάδας Τμήματος τα οποία αναλαμβάνουν τις αρμοδιότητες των αρμοδίων τμημάτων της Διεύθυνσης, σε συνεννόηση με την κεντρική Διεύθυνση και υπό την καθοδήγηση αυτής.